طبق منطقه بندی که توسط دفتر هماهنگی امور استان ها صورت گرفت سازمان های جهاد کشاورزی در پنج منطقه قرار گرفتند.

سازمان جهاد کشاورزی استان فارس، همراه با استان های بوشهر، چهارمحال و بختیاری، خوزستان، کهگیلویه و بویراحمد و هرمزگان در منطقه دو قرار گرفت که با انتخابات صورت گرفته رئیس سازمان جهاد کشاورزی استان فارس به عنوان رئیس منطقه دو کشور انتخاب شد.

رئیس هر منطقه؛ وظایفی از جمله پیگیری تشکیل جلسات مستمر به منظور  بررسی مسایل و مشکلات استان های آن منطقه و همفکری، تبادل اطلاعات و انعکاس مسائل و مشکلات مربوطه  به مدیر کل هماهنگی امور استان ها، معاونین وزیر و مقام عالی وزارت را برعهده دارد.